Se pretende obtener los profesionales necesarios en el sector de la acuicultura con un nivel científico alto, un dominio de técnicas multidisciplinares y responsabilidades de dirección y gestión. Esto implica el desarrollo de las capacidades adecuadas para llevar a cabo investigación, desarrollo e innovación, en los sectores tanto empresarial como público. Los ámbitos en los que los titulados del máster podrían trabajar incluyen, entre otros, la producción acuícola en diferentes grados de responsabilidad, creación de nuevas empresas, consultorías, desarrollo de proyectos a escala nacional o internacional, industrias directamente relacionadas con la acuicultura (como la producción de piensos, medicamentos y vacunas para peces), transformación de productos pesqueros, comercialización, industria farmacéutica y también en varias administraciones públicas y departamentos de investigación en la empresa y el sector público.