El programa pone un especial énfasis en la investigación, y destina una parte sustancial de su tiempo al desarrollo de los proyectos de cada estudiante, con tutorías personalizadas, monitoreo de los mismos, y trabajo en los archivos y bibliotecas de Sevilla, con mención expresa del Archivo General de Indias y de la Escuela de Estudios Hispanoamericanos (CSIC), donde habrán de llevar a cabo sus trabajos de consulta e investigación. Para ello se han previsto diversos seminarios metodológicos que ayudarán a la realización del Trabajo Fin de máster.